Прогноз (как и в большинстве случаев) определяется стадией заболевания. Он несколько разный для разных локализаций опухоли (миндалина, корень языка, мягкое небо, задняя стенка глотки). В целом для I-II стадий заболевания излечение достигается в 80-90% случаев. При III-IV  стадиях прогноз значительно хуже (приводятся самые разные цифры от 15 до 50%). Важным являются не только параметры излеченности больных, но и функциональные результаты. Лечение опухолей ротоглотки может приводить к серьезному ухудшению глотания, артикуляции. В настоящее время нет убедительных доказательств функционального преимущества хирургического и нехирургического подхода в лечении опухолей этой локализации. Хирургическое лечение на современном этапе включает в себя реконструктивный компонент. Последнее представляет собой замещение удаленных тканей т.н. лоскутами или трансплантатами, забранными из других участков тела. Современное развитие этой области хирургии позволяет дать шанс больным,  которые еще 20-30 лет назад считались неизлечимыми.